Uganda abriga a mais antiga universidade do Leste e Central de África, que é a Universidade de Makerere. Esta universidade tem sido o centro de excelência acadêmica por várias décadas, não só para os alunos Ugandans mas também outros estudantes da região. Uganda tem mais de 30 universidades públicas.

A Master of Science é um programa avançado de estudo que pode ser obtido em cerca de dois anos. Muitas escolas oferecem on-line ou a tempo parcial programas de mestrado para que os alunos ocupados podem continuar a sua educação de uma forma que é conveniente para eles.